基因组监测识别全球新兴小麦病菌株

病虫害可能会使全球小麦产量减少20%以上。英国伦敦大学学院的Sergio Latorre及其同事于11月<>日在开放获取期刊PLOS Biology上发表的一项研究表明，基因组监测可能是一种有效的疾病管理工具，能够追踪新兴作物疾病的谱系，并确定培育抗病品系的遗传性状。

全球小麦作物受到小麦瘟病的威胁，小麦瘟病是一种新出现的真菌病害。然而，疾病管理策略并不成功。为了更好地了解新兴的病原体基因型和谱系，研究人员进行了基因组分析和实验室实验。他们对大流行性小麦瘟病真菌的基因组进行了基因分型和测序，并测试了不同品系小麦对稻瘟病真菌的遗传抗性和对杀菌剂的敏感性。

研究人员发现，最近在亚洲和非洲出现的小麦瘟病是由小麦瘟病真菌的单一克隆谱系引起的，赞比亚和孟加拉国的爆发是独立起源的。他们还表明，携带Rmg8基因的小麦品种对这种真菌菌株具有抗性，并且真菌对杀菌剂strobilurin敏感。这些发现强调了基因组监测如何帮助植物育种者更有效地选择性状来开发抗病品系。

这项研究可能提供新的工具来帮助对抗新兴的植物病原体。然而，未来的研究需要解决作物病害对杀虫剂和杀菌剂产生抗药性的可能性，并评估减少对化学投入依赖的其他潜在战略。

根据作者的说法，“在短时间内可能会出现比当前基因型更具破坏性的变异。这可能通过突变或与地方性稻瘟菌种群的性重组发生。这种变异株可能增加了毒力和杀菌剂耐受性，从而增加了管理小麦瘟病的难度。这些发现强调了基因组监测的必要性，以改善对小麦瘟疫真菌在全球范围内的跟踪和监测，并在出现后立即识别出令人担忧的变体。

合著者Sophien Kamoun补充说：“该项目建立在COVID-19大流行最能说明的范式之上，即基因组监测为协调应对传染病爆发增加了一个独特的维度。我们需要保持警惕，并继续对非洲和亚洲的小麦瘟病进行基因组学监测，以便在出现时立即识别出值得关注的变种(VOCs)。